Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rims1Q99NE5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims1Q99NE5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms