Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf6Q99NA9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms