Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atoh8Q99NA2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atoh8Q99NA2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms