Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac9Q99N13 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms