Protein–RNA interactions for Protein: Q99M04

Lias, Lipoyl synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LiasQ99M04 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LiasQ99M04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 359.7 ms