Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Sh3bp5lQ99LH9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Sh3bp5lQ99LH9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Sh3bp5lQ99LH9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Sh3bp5lQ99LH9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp5lQ99LH9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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