Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms