Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms