Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms