Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms