Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim59Q922Y2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms