Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms