Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms