Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms