Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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