Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp1bQ91YK2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms