Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdhac1Q91Y10 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhac1Q91Y10 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms