Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp6Q91WS2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp6Q91WS2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms