Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms