Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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