Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG7

Pafah2, Platelet-activating factor acetylhydrolase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah2Q8VDG7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pafah2Q8VDG7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah2Q8VDG7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms