Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fyco1Q8VDC1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fyco1Q8VDC1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms