Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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