Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8R3C1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms