Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngr3Q8R191 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr3Q8R191 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms