Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hecw1Q8K4P8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms