Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28aQ8K3Y3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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