Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms