Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf39Q8K2Z2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms