Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccm2Q8K2Y9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms