Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms