Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnppd1Q8K158 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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