Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh2d5Q8JZW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh2d5Q8JZW5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms