Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LgsnQ8CIX8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms