Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sidt2Q8CIF6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sidt2Q8CIF6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms