Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo4Q8CHQ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo4Q8CHQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms