Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc9Q8CDN9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms