Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atg4aQ8C9S8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atg4aQ8C9S8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Atg4aQ8C9S8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Atg4aQ8C9S8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Atg4aQ8C9S8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4aQ8C9S8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Atg4aQ8C9S8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Atg4aQ8C9S8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Atg4aQ8C9S8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4aQ8C9S8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Atg4aQ8C9S8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Atg4aQ8C9S8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4aQ8C9S8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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