Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q8C5C9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q8C5C9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q8C5C9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms