Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp5Q8BX09 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms