Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup54Q8BTS4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms