Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdhaf4Q8BTE0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms