Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cxcl16Q8BSU2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cxcl16Q8BSU2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl16Q8BSU2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cxcl16Q8BSU2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cxcl16Q8BSU2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cxcl16Q8BSU2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl16Q8BSU2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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