Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pbrm1Q8BSQ9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms