Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap4Q8BMK4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms