Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem260Q8BMD6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms