Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnrc6bQ8BKI2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms