Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2af1l4Q8BGJ9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms