Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF8

Slc35d3, Solute carrier family 35 member D3, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35d3Q8BGF8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc35d3Q8BGF8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms