Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms